对于转氨酶正常或低于正常值2倍以下的代偿期乙型肝炎肝硬化患者，HBeAg阳性者的治疗指征为HBVDNA≥拷贝/ml、HBeAg阴性者为HBVDNA≥拷贝/ml，无论ALT正常或升高，及早抗病毒治疗。
对于失代偿期乙型肝炎肝硬化患者，只要能检出HBVDNA、不论ALT或AST是否升高，及时开始核苷(酸)类似物抗病毒治疗，以改善肝功能并延缓或减少肝移植的需求。
因需要长期治疗，最好选用耐药发生率低的核苷(酸)类似物治疗，不能随意停药，一旦发生耐药变异，应及时加用其他治疗耐药变异的核苷(酸)类似物。